Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 AXDND1-214ENST00000617277 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 RAET1G-201ENST00000367360 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 A2ML1-AS2-201ENST00000394240 386 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 AC009518.1-202ENST00000415393 1229 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 PHB2P1-201ENST00000434943 890 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 LSM3P3-201ENST00000436601 306 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 AL604028.2-201ENST00000437848 788 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 AC009237.4-201ENST00000441078 238 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 RN7SL228P-201ENST00000470060 303 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 AC106798.1-202ENST00000506819 589 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 AC096754.1-201ENST00000508904 818 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 LECT2-203ENST00000512872 762 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 PSMC1P8-201ENST00000536820 1296 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 AL138974.1-201ENST00000551227 741 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 LINC01837-204ENST00000593211 570 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 AC011443.1-201ENST00000599484 365 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 AC068234.2-201ENST00000619646 522 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 LINC01002-204ENST00000631644 473 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 OR7E161P-202ENST00000641994 1033 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 FKBP5-202ENST00000536438 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 ZNF438-203ENST00000375311 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 ZNF761-202ENST00000432094 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 RNA5SP427-201ENST00000365323 119 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 TRBV19-201ENST00000390393 552 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC090617.1-201ENST00000413674 323 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC093107.1-201ENST00000422772 609 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 SNRPEP5-201ENST00000425442 278 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 LINC01723-201ENST00000432244 601 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 RN7SL308P-201ENST00000464971 297 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 RPL34P34-201ENST00000465389 354 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 TAAR3P-201ENST00000466706 1078 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 RN7SL392P-201ENST00000473024 299 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 TAAR3P-202ENST00000481759 1025 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 CREM-242ENST00000490511 469 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC104109.4-202ENST00000518409 1082 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC027288.1-201ENST00000548359 816 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 HIGD1AP9-201ENST00000550710 279 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
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