Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 C5orf63-201ENST00000296662 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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RTL8BQ17RB0 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 SCP2-207ENST00000435345 894 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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RTL8BQ17RB0 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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RTL8BQ17RB0 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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RTL8BQ17RB0 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 CASP1P2-201ENST00000526830 1258 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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RTL8BQ17RB0 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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RTL8BQ17RB0 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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RTL8BQ17RB0 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
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RTL8BQ17RB0 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
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RTL8BQ17RB0 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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RTL8BQ17RB0 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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RTL8BQ17RB0 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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RTL8BQ17RB0 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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RTL8BQ17RB0 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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RTL8BQ17RB0 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 MEF2C-AS1-211ENST00000514092 501 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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