Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 RPL7L1P7-201ENST00000509986 724 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AZIN1-AS1-211ENST00000520455 480 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 KC877392.1-201ENST00000524855 426 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 NF1P12-201ENST00000549593 583 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC068152.1-203ENST00000570314 254 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 MIR4312-201ENST00000579909 76 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 RPS4XP16-202ENST00000595905 807 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC097467.3-210ENST00000597939 705 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC026333.4-201ENST00000613543 544 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AL078581.3-201ENST00000627304 744 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 JAKMIP2-AS1-202ENST00000627433 831 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 MAP3K19-206ENST00000392918 1460 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC010132.4-201ENST00000569883 1368 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 FGD6-205ENST00000549499 3757 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 DNASE1L3-201ENST00000394549 1294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC226101.1-201ENST00000401483 387 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 RNU2-5P-201ENST00000410533 180 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 LRRC23-208ENST00000436789 796 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 LINC01762-205ENST00000437308 539 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AL139135.2-201ENST00000445040 433 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 RPL6P24-201ENST00000445338 864 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 FAM177B-204ENST00000445590 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AL133215.1-201ENST00000447344 342 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AL354953.1-201ENST00000457852 479 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 HLTF-AS1-201ENST00000492461 415 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC010655.2-201ENST00000493710 662 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 PFN2-213ENST00000494827 793 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC109454.2-201ENST00000503470 520 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 ENPP7P3-201ENST00000509123 241 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 RN7SKP242-201ENST00000515967 289 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC007950.1-201ENST00000560465 615 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 HNRNPA1P74-201ENST00000560782 835 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC126323.4-201ENST00000566935 234 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC245033.2-201ENST00000621893 421 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC027559.1-201ENST00000636288 271 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.9 ms