Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 TGIF1-211ENST00000548489 1536 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SP140Q13342 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SP140Q13342 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SP140Q13342 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SP140Q13342 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SP140Q13342 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SP140Q13342 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SP140Q13342 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SP140Q13342 GRXCR2-201ENST00000377976 2002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SP140Q13342 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SP140Q13342 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SP140Q13342 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SP140Q13342 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SP140Q13342 GTF2H3-201ENST00000228955 1472 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SP140Q13342 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SP140Q13342 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SP140Q13342 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SP140Q13342 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SP140Q13342 MS4A12-201ENST00000016913 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SP140Q13342 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SP140Q13342 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SP140Q13342 TRGV3-201ENST00000390346 537 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SP140Q13342 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
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SP140Q13342 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
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SP140Q13342 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
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SP140Q13342 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 SEC61G-201ENST00000352861 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SP140Q13342 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
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