Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AL023806.3-201ENST00000638502 2704 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 ZNF271P-201ENST00000399070 5124 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 ZDBF2-201ENST00000374423 10286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 OR9L1P-201ENST00000529493 933 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AL008638.3-201ENST00000623027 5182 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AL590705.5-202ENST00000375204 3161 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC089998.1-201ENST00000548575 3141 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 C14orf166-201ENST00000261700 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 PREPL-203ENST00000378520 2308 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 RNF145-209ENST00000520638 2340 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 ARL6-204ENST00000463745 4231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AL590762.1-201ENST00000391782 432 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC026367.2-201ENST00000610630 553 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 CLEC5A-206ENST00000546910 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AL596244.1-201ENST00000567068 3779 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AOAH-210ENST00000617267 2398 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 GCNA-201ENST00000373695 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 BBOX1-201ENST00000263182 1886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 CYSLTR2-202ENST00000614739 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 TNFAIP8-204ENST00000503646 2502 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 KRTAP3-4P-201ENST00000430780 280 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 KIAA0391-201ENST00000250377 6118 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 NOX1-204ENST00000372966 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 CNPY1-201ENST00000321736 2378 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 PDLIM5-219ENST00000514743 3356 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 ZNF625-ZNF20-201ENST00000430024 2651 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 WDCP-202ENST00000406895 3700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC127024.8-201ENST00000623719 2094 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 OVAAL-201ENST00000442621 1489 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 NCAPH-205ENST00000455200 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC131009.3-201ENST00000621809 287 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 MR1-205ENST00000434571 7479 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 EPB41-201ENST00000343067 5956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
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