Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PRKCHP24723 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms