Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 GJB7-203ENST00000525899 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 LIG3-202ENST00000378526 8400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC107884.1-207ENST00000504206 4433 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 ATP6V0E1-201ENST00000265093 773 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 TAAR8-201ENST00000275200 1029 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 VNN3-201ENST00000275223 1260 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 FAM49A-201ENST00000381323 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AP001042.1-201ENST00000416842 487 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 RPL17P17-201ENST00000419491 557 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 OR5P4P-201ENST00000424698 917 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 MED15P9-201ENST00000424716 533 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 HIST1H2APS6-201ENST00000448609 364 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AL135908.1-202ENST00000454135 562 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 RN7SL740P-201ENST00000467060 344 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC117395.3-201ENST00000471176 680 ntTSL 4 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC079944.1-201ENST00000485426 495 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 RN7SL647P-201ENST00000485429 300 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC090835.1-201ENST00000515189 1024 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC008013.2-201ENST00000537555 348 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC022558.2-201ENST00000566841 754 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC000068.3-201ENST00000607934 427 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 7SK.12-201ENST00000612820 244 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC124319.3-201ENST00000616832 526 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 PCBP1-AS1-322ENST00000628147 553 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 MCM8-205ENST00000610722 7486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 PRDM2-203ENST00000343137 5797 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 XIAP-202ENST00000371199 8591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 SERPINE2-203ENST00000409840 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 SLFN13-204ENST00000526861 6004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 VTI1A-202ENST00000432306 1738 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC245060.6-201ENST00000624350 8420 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 KIAA1024-201ENST00000305428 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 USF3-201ENST00000316407 13708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 KIF1B-202ENST00000377081 8746 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 HPS4-201ENST00000336873 3786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 ZNF365-204ENST00000395251 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 GABRP-203ENST00000518525 3576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 PUM1-204ENST00000373747 5375 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 ZNF121-201ENST00000320451 1563 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 KYNU-203ENST00000409512 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 PPP2R5C-218ENST00000556260 2013 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 GRIP1-201ENST00000359742 5216 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 ANKS1B-211ENST00000547776 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 EEF1A1P3-201ENST00000417549 1385 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 MPZL3-201ENST00000278949 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 KIDINS220-202ENST00000319688 3765 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 NFIA-208ENST00000407417 2123 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 RABGEF1-203ENST00000439720 3065 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 TRIM49-202ENST00000532501 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 SERPINA1-206ENST00000437397 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 GOLGA6L1-201ENST00000614055 2620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 CCDC63-204ENST00000552694 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 PIGN-231ENST00000639174 4095 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 SMIM31-201ENST00000507311 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 BTN2A1-201ENST00000312541 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 METTL2A-204ENST00000616852 3150 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 DLG1-202ENST00000357674 4931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 VN2R1P-201ENST00000449668 1743 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 SCOC-AS1-201ENST00000512692 1987 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 MIAT-218ENST00000613780 10143 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 PAIP2B-201ENST00000244221 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AL353807.3-201ENST00000500626 2505 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC009220.2-201ENST00000489759 1751 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 BCAT1-202ENST00000342945 4319 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 ATP5J2-201ENST00000292475 607 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 RNA5SP463-201ENST00000363030 120 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 ALOX5AP-201ENST00000380490 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
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