Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 PMS2P3-203ENST00000422064 567 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AP003548.1-201ENST00000523862 711 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 RPL27A-210ENST00000531978 867 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AP003115.1-201ENST00000569849 463 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 SETP3-201ENST00000581726 813 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC006305.3-201ENST00000590589 454 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AL049840.5-201ENST00000602827 552 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC005277.2-201ENST00000617898 390 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AL450990.1-201ENST00000632868 582 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 GJB6-205ENST00000636852 1840 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 LINC02466-201ENST00000500092 1963 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC009135.2-201ENST00000624136 1768 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC096736.3-201ENST00000510753 993 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC024145.1-201ENST00000535324 775 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
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