Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 LINC01593-201ENST00000424355 388 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TCF23Q7RTU1 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms