Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 FAAHP1-207ENST00000635606 398 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 NCOA4-206ENST00000585056 2124 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AL356479.1-203ENST00000411798 1440 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 OR2AT4-201ENST00000305159 1042 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 PTTG1-201ENST00000352433 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 RN7SKP189-201ENST00000365042 330 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 C1orf54-203ENST00000369102 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC073367.1-201ENST00000421480 697 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AL357314.1-201ENST00000433521 806 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 LIX1L-AS1-207ENST00000448561 347 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 LINC01839-201ENST00000451348 727 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC018980.1-201ENST00000457848 862 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 RPS2P25-201ENST00000467247 580 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC139491.5-201ENST00000510029 920 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC114947.1-201ENST00000511991 432 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 NDUFA3P2-201ENST00000531434 232 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AL049869.4-201ENST00000555669 178 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 RN7SL25P-201ENST00000583862 260 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AL589765.5-201ENST00000596133 515 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 ZNF675-204ENST00000599168 592 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC006115.1-201ENST00000599726 517 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC104117.5-201ENST00000606195 547 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 GMDS-AS1-215ENST00000606884 580 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 TPT1-AS1-221ENST00000618947 520 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AL078581.3-201ENST00000627304 744 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 MAK-205ENST00000538030 2459 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 ZFY-207ENST00000625061 2273 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.1 ms