Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SS18Q15532 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SS18Q15532 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SS18Q15532 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SS18Q15532 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SS18Q15532 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SS18Q15532 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SS18Q15532 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SS18Q15532 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SS18Q15532 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SS18Q15532 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SS18Q15532 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SS18Q15532 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SS18Q15532 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SS18Q15532 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SS18Q15532 AC092634.1-201ENST00000366505 199 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SS18Q15532 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
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SS18Q15532 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SS18Q15532 RPL6P21-201ENST00000418672 846 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SS18Q15532 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SS18Q15532 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
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SS18Q15532 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
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SS18Q15532 AC234771.4-201ENST00000441416 730 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SS18Q15532 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SS18Q15532 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SS18Q15532 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
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SS18Q15532 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
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SS18Q15532 SEC61G-201ENST00000352861 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
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SS18Q15532 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
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SS18Q15532 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SS18Q15532 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
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SS18Q15532 RNA5SP231-201ENST00000410496 138 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SS18Q15532 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
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SS18Q15532 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SS18Q15532 AC016745.1-201ENST00000422178 508 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SS18Q15532 AC092646.1-201ENST00000427142 901 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SS18Q15532 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SS18Q15532 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SS18Q15532 AC083855.1-201ENST00000440041 258 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SS18Q15532 AC106874.1-201ENST00000440495 646 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SS18Q15532 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SS18Q15532 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SS18Q15532 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
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