Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 TP53TG1_2.1-201ENST00000611226 182 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 RNASE11-211ENST00000620912 883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 GOSR2-222ENST00000639031 885 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 TRIM75P-201ENST00000503032 1407 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 CYP51A1-204ENST00000450723 1729 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 RPL12P10-201ENST00000413498 498 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AL583805.2-201ENST00000418571 486 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC073188.3-201ENST00000425228 339 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 RBMY2JP-201ENST00000425544 1059 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC009303.1-201ENST00000426307 352 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AP003385.1-201ENST00000426387 893 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 CHCHD4P5-201ENST00000436684 427 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AL133480.2-201ENST00000456723 487 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC084024.1-201ENST00000476186 621 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 C8orf37-AS1-201ENST00000517437 456 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 TPT1-AS1-213ENST00000521336 759 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 LINC01559-203ENST00000531049 683 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 LINC01146-206ENST00000556684 361 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC092718.4-201ENST00000566639 716 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC091932.1-201ENST00000569381 427 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC087292.1-201ENST00000573371 512 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 MIR4685-201ENST00000578185 69 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 RN7SL311P-201ENST00000579858 306 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 RAB28P4-201ENST00000622233 665 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AF121898.1-201ENST00000440763 1860 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC007878.1-201ENST00000434786 1615 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 S100B-203ENST00000397648 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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