Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 WNT2B-203ENST00000369686 10879 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 CELF2-203ENST00000416382 6894 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 PBRM1-203ENST00000356770 7523 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 ALMS1-206ENST00000613296 12925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 BRD8-202ENST00000254900 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 MAP4K4-206ENST00000413150 6958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 ZNF23-204ENST00000428724 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 ITPR1-202ENST00000354582 10242 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 GGCX-201ENST00000233838 7569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 ATP10B-202ENST00000327245 7566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 AC068189.1-201ENST00000501164 2632 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 ZNF227-213ENST00000621083 3055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 CHD2-201ENST00000394196 9363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 AC060780.1-202ENST00000590740 5084 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 CIITA-201ENST00000324288 11952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 ZNF793-201ENST00000445217 6712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 MITF-203ENST00000328528 4680 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 EP400-204ENST00000389561 12317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 NPHP1-203ENST00000393272 2752 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 ZNF385D-201ENST00000281523 10699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 RNF146-215ENST00000616343 2077 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 HSD17B13-201ENST00000302219 2269 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 GALK2-201ENST00000327171 5299 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 IPO5-222ENST00000490680 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms