Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AC007283.1-201ENST00000434645 445 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 LINC02217-201ENST00000505844 687 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AC087392.1-201ENST00000576252 820 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 C11orf1-203ENST00000529270 1437 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.4 ms