Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC079385.3-201ENST00000552415 809 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AL445383.1-201ENST00000554689 874 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 ANP32BP1-202ENST00000568553 737 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC131009.3-201ENST00000621809 287 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 TEX41-255ENST00000626404 610 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 MAK-205ENST00000538030 2459 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 LINC01991-202ENST00000446091 1524 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
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ATP1A4Q13733 RNU1-55P-201ENST00000365510 158 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
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ATP1A4Q13733 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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ATP1A4Q13733 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
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ATP1A4Q13733 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 RNASE11-211ENST00000620912 883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AL121936.2-201ENST00000641935 662 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
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