Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 AP3M1-201ENST00000355264 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 YIPF4-201ENST00000238831 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 UNC79-206ENST00000621021 7377 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 CTNND1-201ENST00000358694 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 MAP3K20-201ENST00000338983 7179 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 MYOF-201ENST00000358334 6680 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 GTF2A1-203ENST00000553612 6306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 ASB15-206ENST00000451558 4788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC8.9□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC8.9□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC8.9□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC8.9□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 DTNA-225ENST00000595022 6016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 PREPL-203ENST00000378520 2308 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC8.9□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 LIMD1-201ENST00000273317 11331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 CTNND1-203ENST00000361391 6232 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC8.9□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 ATP1B4-203ENST00000539306 4644 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 PDE4DIP-246ENST00000618462 8150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 C14orf166-201ENST00000261700 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 AC068535.1-201ENST00000416008 471 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC8.89□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 OR7A1P-201ENST00000601206 970 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 TRPM8-201ENST00000324695 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 AC068189.1-201ENST00000501164 2632 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 TNPO1-201ENST00000337273 11183 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms