Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 AC016144.1-201ENST00000548175 1087 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 AP000577.1-201ENST00000624366 878 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 HMGN2P46-204ENST00000409454 1923 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 TGIF1-211ENST00000548489 1536 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 RRS1-AS1-201ENST00000499642 4366 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 UGT2B27P-201ENST00000505092 1620 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F1Q01094 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 OR9L1P-201ENST00000529493 933 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AL591767.3-201ENST00000554632 525 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC145350.2-201ENST00000561541 821 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC015818.6-201ENST00000584274 634 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC011443.1-201ENST00000599484 365 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC243919.1-201ENST00000613086 785 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.1 ms