Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AL035420.1-202ENST00000450129 357 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 LINC01492-201ENST00000411575 3738 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 ZNF415-204ENST00000594011 2630 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AP3M1-201ENST00000355264 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 MYCBP2-212ENST00000612956 1542 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 CYCSP17-201ENST00000407870 315 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AL513329.1-201ENST00000426575 657 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 OR4A13P-201ENST00000529316 942 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AC011462.3-201ENST00000598988 540 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 CDH19-203ENST00000540086 1963 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 TMEM75-201ENST00000624314 2165 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 ZMAT1-206ENST00000540921 3139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 MED23-201ENST00000354577 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 COX7B-203ENST00000481445 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AC017035.1-201ENST00000411999 1115 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AC011352.2-201ENST00000514574 1016 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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