Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 ADAMTS3-204ENST00000622135 4479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 MED28-201ENST00000237380 10868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 SIPA1L1-202ENST00000381232 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 MRAP-202ENST00000339944 440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 MIR548A1HG-202ENST00000637804 784 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 SLC23A2-202ENST00000379333 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 TIA1-201ENST00000282574 3823 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 VTA1-202ENST00000367630 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 DYNC1I2P1-201ENST00000435916 1838 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 NCKAP1-202ENST00000361354 20347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 IL1RAP-201ENST00000072516 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 CXCR6-204ENST00000458629 2805 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 GABRA1-211ENST00000635880 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 CHD8-201ENST00000399982 8229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 AL445649.1-201ENST00000615941 691 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 NCOA4-205ENST00000583565 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 C11orf63-203ENST00000531316 2782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 BDNF-AS-201ENST00000499008 2324 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 LIPG-201ENST00000261292 10441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 DTNA-225ENST00000595022 6016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms