Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 LRTOMT-209ENST00000440313 253 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 AC022080.2-201ENST00000452932 533 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 C8orf37-AS1-201ENST00000517437 456 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 AC091096.2-201ENST00000523284 587 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 LINC01559-203ENST00000531049 683 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 AC091932.1-201ENST00000569381 427 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
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CASQ1P31415 AC007347.2-201ENST00000623044 180 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 AC006387.1-201ENST00000626365 671 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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CASQ1P31415 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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CASQ1P31415 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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CASQ1P31415 MGST1-205ENST00000396210 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
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CASQ1P31415 EEF1GP6-201ENST00000402309 905 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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CASQ1P31415 LINC01762-205ENST00000437308 539 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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CASQ1P31415 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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CASQ1P31415 FAM177B-204ENST00000445590 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 RPL21P42-201ENST00000488408 464 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 ADAM3A-209ENST00000497806 1245 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 MIR4685-201ENST00000578185 69 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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CASQ1P31415 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 AL137000.1-201ENST00000610528 1244 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
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