Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AC099654.11-201ENST00000638857 294 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
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PTPRCP08575 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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PTPRCP08575 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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PTPRCP08575 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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PTPRCP08575 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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PTPRCP08575 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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PTPRCP08575 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
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PTPRCP08575 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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PTPRCP08575 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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