Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AK6-203ENST00000502819 743 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 LINC00640-204ENST00000557295 708 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 TCF12-205ENST00000537840 1598 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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CLDN9O95484 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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CLDN9O95484 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
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CLDN9O95484 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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