Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC002127.1-201ENST00000421305 225 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 RPSAP41-201ENST00000439695 860 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 SNX24-205ENST00000506996 588 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC007066.2-202ENST00000566531 914 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AL357153.4-201ENST00000620487 1016 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 TCF12-213ENST00000559703 1544 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC012358.3-204ENST00000599475 978 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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