Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 USP9YP3-201ENST00000434481 1766 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 BTRC-204ENST00000408038 5982 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 FAT2-201ENST00000261800 14534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL1Q9NSC2 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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