Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 CACNB4-219ENST00000636108 1698 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 HLF-210ENST00000575345 3589 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 FBLN5-205ENST00000556154 1875 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 MIR17HG-202ENST00000581816 2032 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 PAPOLG-201ENST00000238714 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 CRBN-201ENST00000231948 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 CLCN3-209ENST00000513761 6692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AC051619.3-201ENST00000560646 2426 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 IGF1-206ENST00000456098 7370 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 KLHL2-202ENST00000421009 2452 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 USP9X-201ENST00000324545 12401 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 TNFSF15-201ENST00000374044 2789 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 OR51E2-201ENST00000396950 2781 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 TMEM72-AS1-201ENST00000450287 3300 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AP2B1-217ENST00000618940 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 KRT73-AS1-203ENST00000552364 3808 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 PDGFC-203ENST00000502773 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 SPATA31A1-201ENST00000377647 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 SPATA31A7-206ENST00000619167 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 SLC4A8-203ENST00000453097 11824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 IL1B-201ENST00000263341 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 SELP-201ENST00000263686 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 PDXDC1-201ENST00000325823 1113 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 ZMYM6-203ENST00000373333 1473 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 MSL3-206ENST00000380693 2377 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 TRAV12-3-201ENST00000390442 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 LDHAP5-201ENST00000394996 622 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 RN7SKP254-201ENST00000410685 310 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 RPLP1P10-201ENST00000413972 339 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 NUCB1-AS1-201ENST00000416432 433 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 CHCHD3P1-201ENST00000425516 676 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 RPL5P6-201ENST00000425640 886 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 LARP1B-203ENST00000432347 2707 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 RPL3P11-201ENST00000434028 1146 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 LINC00570-203ENST00000437795 490 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 WDR82P2-201ENST00000444540 928 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 RPL7L1P11-201ENST00000446092 721 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AC026336.1-201ENST00000466577 351 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 RPL9P15-201ENST00000491096 532 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 RN7SL350P-201ENST00000492591 299 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AC096741.2-201ENST00000510225 637 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AC244502.1-201ENST00000514473 1951 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AC027801.3-201ENST00000515049 698 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 GLYATL1P4-201ENST00000529326 906 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 CCDC77-210ENST00000540180 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 CNEP1R1-204ENST00000562576 656 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AC026464.2-201ENST00000567834 2421 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 RN7SL366P-201ENST00000577957 292 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AC061975.5-201ENST00000584928 1441 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AC023513.1-201ENST00000604396 691 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AC247036.1-201ENST00000605005 389 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 WDR11-AS1-204ENST00000608667 522 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AC010333.3-201ENST00000615100 402 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AC025287.2-201ENST00000621911 668 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 CU638689.4-205ENST00000623313 596 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AC119674.1-201ENST00000641611 1210 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 RASGRP3-203ENST00000407811 4210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 ELMO2-203ENST00000372176 3678 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 EPHA4-203ENST00000409938 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 SLFN12L-201ENST00000260908 3119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 PPP4R3CP-201ENST00000412172 3131 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 IQCA1-206ENST00000431676 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 KIAA0391-203ENST00000534898 2611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 MRO-201ENST00000256425 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 UBE2V1-201ENST00000340309 2536 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms