Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 ZCCHC2-204ENST00000586834 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 MCM8-205ENST00000610722 7486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 GON4L-201ENST00000271883 7138 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 PGAP1-201ENST00000354764 11114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 NAT1-206ENST00000518029 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 GCNT1-202ENST00000442371 5972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 CHRM3-201ENST00000255380 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 BRD7-202ENST00000394689 2145 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 DTNA-225ENST00000595022 6016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 GRIA4-212ENST00000530497 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 NFIB-218ENST00000636432 1953 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 GANC-201ENST00000318010 7781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 FANCM-201ENST00000267430 7111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 ANKRD36BP2-207ENST00000622311 5398 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 OSGEPL1-207ENST00000522700 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
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COL4A6Q14031 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 COX7B2-202ENST00000396533 617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
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COL4A6Q14031 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
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COL4A6Q14031 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
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COL4A6Q14031 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 SLC4A8-203ENST00000453097 11824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 FRYL-210ENST00000507711 5277 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 AC008937.3-201ENST00000606813 1700 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 AL359922.2-201ENST00000581788 3017 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
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