Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC007283.1-201ENST00000434645 445 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
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