Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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ITGB3BPQ13352 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
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ITGB3BPQ13352 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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ITGB3BPQ13352 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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ITGB3BPQ13352 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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ITGB3BPQ13352 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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ITGB3BPQ13352 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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ITGB3BPQ13352 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
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