Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 FAM135A-207ENST00000457062 5282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 GPBP1-208ENST00000514387 3310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 LRRC37B-203ENST00000394713 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 CDH12-202ENST00000504376 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 ZMYM6-203ENST00000373333 1473 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 TRIM60P19-201ENST00000452879 1462 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 WDR76-201ENST00000263795 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 ZSCAN5A-201ENST00000391713 3562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 THADA-202ENST00000402360 2974 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 MRPS5P4-201ENST00000592830 325 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AL049840.5-201ENST00000602827 552 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 LINC01968-202ENST00000423318 3647 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 PJA2-201ENST00000361189 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 ZNF585B-203ENST00000527838 2732 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 PPFIA2-205ENST00000541570 2976 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 KAT6B-202ENST00000372711 7560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AL450327.1-201ENST00000430931 2632 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 THSD4-AS1-202ENST00000562634 2182 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 DAZ3-201ENST00000315357 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 DAZ2-201ENST00000382294 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 DAZ4-204ENST00000415508 3277 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 OR4M1-201ENST00000315957 1116 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 NPM1P51-201ENST00000443470 744 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 FOXG1-AS1-203ENST00000551395 602 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 ZNF677-206ENST00000598513 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 LPA-201ENST00000316300 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 PARD3-212ENST00000544292 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 ERVW-1-202ENST00000603053 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 ENTPD5-207ENST00000557325 3096 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 ZNF426-201ENST00000253115 7085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 RBBP4P4-201ENST00000398588 1289 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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