Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ERCC6Q03468 LPP-208ENST00000448637 5835 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ERCC6Q03468 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ERCC6Q03468 CLIC5-201ENST00000185206 6023 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ERCC6Q03468 GRIA4-206ENST00000525187 2822 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ERCC6Q03468 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ERCC6Q03468 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ERCC6Q03468 GANC-201ENST00000318010 7781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ERCC6Q03468 AC006141.1-201ENST00000581917 2170 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ERCC6Q03468 IL16-204ENST00000394660 9616 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ERCC6Q03468 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ERCC6Q03468 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ERCC6Q03468 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ERCC6Q03468 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ERCC6Q03468 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ERCC6Q03468 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ERCC6Q03468 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ERCC6Q03468 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ERCC6Q03468 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ERCC6Q03468 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ERCC6Q03468 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ERCC6Q03468 AC087269.2-201ENST00000641764 975 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ERCC6Q03468 NEK2P4-201ENST00000425793 1329 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ERCC6Q03468 AL512310.3-201ENST00000547023 1335 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ERCC6Q03468 AC015849.5-201ENST00000604907 5473 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ERCC6Q03468 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 NOS1-206ENST00000618760 12283 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 SERPINB4-201ENST00000341074 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 ABCB4-202ENST00000358400 3826 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 KIF6-202ENST00000287152 9082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 BPTF-203ENST00000335221 2627 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 RN7SL870P-201ENST00000460111 296 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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ERCC6Q03468 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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ERCC6Q03468 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 SLC12A6-201ENST00000290209 7286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 DLG2-209ENST00000418306 3027 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 OFD1P10Y-201ENST00000434110 1433 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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ERCC6Q03468 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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ERCC6Q03468 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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ERCC6Q03468 NBPF19-206ENST00000621744 14425 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 KCNIP4-201ENST00000359001 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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ERCC6Q03468 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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ERCC6Q03468 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 TEP1-201ENST00000262715 10695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 TDRKH-201ENST00000368822 3093 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 TENM4-201ENST00000278550 14000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 ADAM3A-207ENST00000490268 2627 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ERCC6Q03468 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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