Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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HOXD13P35453 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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HOXD13P35453 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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HOXD13P35453 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 TPPP2-208ENST00000530140 703 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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