Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AL031123.3-201ENST00000623345 1837 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01593-201ENST00000424355 388 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00483-203ENST00000450727 686 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AP004607.6-201ENST00000525033 1202 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AL117336.3-201ENST00000603160 1107 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 CDY5P-201ENST00000411487 1580 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 CDY9P-201ENST00000451397 1580 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms