Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 AC107977.1-201ENST00000355745 939 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 AC004012.1-201ENST00000416593 534 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 OR6R1P-201ENST00000431838 940 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 RBMY2HP-201ENST00000457961 720 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 CT45A5-201ENST00000487941 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 H3F3AP3-201ENST00000497682 407 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 ANAPC10-213ENST00000512680 505 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 TPRXL-210ENST00000532753 478 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 KLRD1-209ENST00000543420 802 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 AC104823.1-201ENST00000413290 989 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KLHL13Q9P2N7 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms