Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC044784.1-201ENST00000456526 677 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AP001610.2-201ENST00000415820 422 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AL133268.4-201ENST00000424868 472 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 TRGC2-201ENST00000436911 1013 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 ZNF969P-201ENST00000510345 2341 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 IFNG-AS1-202ENST00000538665 1791 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 LINC01114-201ENST00000421071 482 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL612P-201ENST00000497704 295 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms