Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 TBC1D29-204ENST00000584297 602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AL109936.2-201ENST00000605350 650 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 CASC15-205ENST00000606336 1288 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 ZNF710-AS1-202ENST00000620791 2133 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 DSG1-201ENST00000257192 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 NPEPPS-201ENST00000322157 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 C11orf44-201ENST00000317019 3547 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 RPLP0P2-206ENST00000496593 3525 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 LTBP1-204ENST00000407925 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 RBBP9-201ENST00000337227 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 GABPA-201ENST00000354828 5120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 ZSCAN32-212ENST00000574940 2180 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 BUB1-212ENST00000535254 3576 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 ISX-202ENST00000404699 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 GTF2IP7-201ENST00000434037 2399 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 PDE9A-207ENST00000398224 1671 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 PDE9A-210ENST00000398229 1684 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 ZNF181-201ENST00000392232 2791 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 CNBD2-205ENST00000538900 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 RNF214-204ENST00000530849 2846 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 DNAJC5B-201ENST00000276570 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 UBE2V2-204ENST00000520809 2450 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AC097375.3-201ENST00000515329 2652 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 CDC42SE2-208ENST00000505065 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 ABI2-211ENST00000422511 2718 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 CHRNA1-202ENST00000348749 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 ANKRD50-201ENST00000504087 8794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 RPP14-201ENST00000295959 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 LINC01531-202ENST00000536898 3312 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 COL17A1-203ENST00000393211 1610 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 PAN2-201ENST00000257931 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 PCDH11Y-202ENST00000333703 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 ITGA6-206ENST00000442250 3393 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 SLFN11-201ENST00000308377 4910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 APOL1-201ENST00000319136 3000 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 KCNIP2-202ENST00000343195 663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AL356432.2-201ENST00000407841 422 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 LINC00665-202ENST00000427868 690 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 CTBP2P1-201ENST00000431853 245 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 PAX8-AS1-208ENST00000456685 1207 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AC108865.1-201ENST00000507644 496 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AC104031.1-201ENST00000527726 372 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 CD300LF-208ENST00000581500 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 DTNA-220ENST00000590831 847 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AC093503.1-202ENST00000598743 478 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 STX8P1-201ENST00000603161 355 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 TRIM43-201ENST00000272395 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 THAP12P3-201ENST00000456373 2266 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 ZNF615-208ENST00000598071 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 ATP8A2-201ENST00000255283 3287 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 TBCK-202ENST00000361687 3312 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 EFCAB11-208ENST00000555872 2716 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 ZP2-203ENST00000574002 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 ACSL6-206ENST00000379255 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 PKD1L3-201ENST00000620267 5199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 CARMN-201ENST00000505254 3950 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 AGBL2-203ENST00000525123 3577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LHX8Q68G74 ZHX1-206ENST00000522655 3357 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms