Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 OSBPL6-207ENST00000409631 3273 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms