Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AC063955.1-201ENST00000462872 685 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AC099328.2-201ENST00000465347 455 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 OR4X2-201ENST00000624868 1025 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AC022075.1-201ENST00000500682 2830 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 SLC9A4-201ENST00000295269 4138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 DPCR1-201ENST00000304311 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 SNX25-202ENST00000504273 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AC008560.1-201ENST00000510585 1766 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 GDPD4-202ENST00000376217 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 METTL8-217ENST00000612742 8132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 BRD8-204ENST00000411594 2967 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 APP-206ENST00000359726 3294 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 B3GNT2-202ENST00000405767 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 KLHL5-201ENST00000261425 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 CBR4-201ENST00000306193 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 SUMO3-202ENST00000397893 520 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 LINC00354-201ENST00000412119 347 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 FABP5P1-201ENST00000423401 411 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 NPIPB5-205ENST00000424340 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 E2F6P3-201ENST00000441743 743 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 VNN3-210ENST00000450865 596 ntTSL 4 BASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AL390728.3-201ENST00000452704 270 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AL117382.2-201ENST00000455642 403 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AC129807.1-201ENST00000471614 591 ntTSL 4 BASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 RN7SL790P-201ENST00000474043 298 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 RAB7A-205ENST00000485280 507 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AC138035.1-201ENST00000499986 992 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 PTTG2-201ENST00000504686 691 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AC097494.1-201ENST00000512898 732 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AC140063.1-201ENST00000541343 259 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AP005230.1-204ENST00000579097 779 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 IGKV2OR2-7D-201ENST00000603664 304 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 IGKV2OR2-7-201ENST00000604652 304 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AC005858.3-201ENST00000624756 589 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 TSHZ2-205ENST00000626626 670 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AQP4-205ENST00000581374 1586 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AMY1A-201ENST00000370083 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 ZNF806-201ENST00000438300 1774 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 ZNF81-204ENST00000376954 7933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 MDM4-205ENST00000391947 10008 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 MFSD8-217ENST00000641178 4374 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 PTK2-207ENST00000517887 4661 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 DNAH17-202ENST00000585328 13708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 MRPS27-202ENST00000457646 2628 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 CXCR6-202ENST00000438735 2242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 C2CD6-201ENST00000286195 2104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 ZNF763-202ENST00000358987 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 VDAC2-214ENST00000543351 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms