Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC016405.1-202ENST00000524348 758 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC021079.1-201ENST00000625268 907 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC087392.3-202ENST00000358446 1754 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 MTHFD1P1-201ENST00000413059 2764 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC007359.1-202ENST00000419158 2939 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC008175.1-201ENST00000446299 2939 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 GTF2E1-201ENST00000283875 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 LINC01991-202ENST00000446091 1524 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 GARNL3-205ENST00000435213 3599 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 IL1RAP-201ENST00000072516 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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FOXF2Q12947 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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FOXF2Q12947 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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FOXF2Q12947 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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FOXF2Q12947 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC106800.2-201ENST00000514009 1103 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 HID1-AS1-201ENST00000577295 815 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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