Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
TMPOP42166 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AC010480.1-201ENST00000624823 684 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TMPOP42166 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
TMPOP42166 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TMPOP42166 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
TMPOP42166 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TMPOP42166 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TMPOP42166 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TMPOP42166 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TMPOP42166 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TMPOP42166 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TMPOP42166 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TMPOP42166 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TMPOP42166 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TMPOP42166 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TMPOP42166 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TMPOP42166 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TMPOP42166 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TMPOP42166 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TMPOP42166 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TMPOP42166 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TMPOP42166 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TMPOP42166 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TMPOP42166 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TMPOP42166 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TMPOP42166 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TMPOP42166 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AC139099.1-201ENST00000573737 976 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TMPOP42166 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TMPOP42166 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TMPOP42166 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TMPOP42166 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TMPOP42166 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TMPOP42166 Z93929.1-201ENST00000418200 1475 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TMPOP42166 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TMPOP42166 LIPA-203ENST00000371837 2513 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TMPOP42166 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TMPOP42166 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TMPOP42166 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TMPOP42166 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TMPOP42166 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TMPOP42166 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TMPOP42166 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TMPOP42166 LINC01268-201ENST00000434296 2755 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TMPOP42166 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TMPOP42166 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TMPOP42166 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TMPOP42166 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TMPOP42166 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TMPOP42166 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TMPOP42166 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TMPOP42166 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TMPOP42166 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TMPOP42166 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TMPOP42166 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TMPOP42166 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TMPOP42166 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TMPOP42166 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TMPOP42166 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TMPOP42166 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TMPOP42166 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TMPOP42166 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TMPOP42166 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TMPOP42166 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TMPOP42166 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TMPOP42166 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TMPOP42166 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TMPOP42166 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms