Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 NEDD9-208ENST00000504387 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AC108136.1-201ENST00000530350 631 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 Metazoa_SRP.106-201ENST00000622471 296 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 RAPGEF4-214ENST00000538974 3920 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 FAT2-201ENST00000261800 14534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 GCNA-201ENST00000373695 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AC244100.2-202ENST00000612584 3878 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 ADAM3A-207ENST00000490268 2627 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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HOXD10P28358 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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HOXD10P28358 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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HOXD10P28358 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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HOXD10P28358 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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HOXD10P28358 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 TMBIM6-209ENST00000547798 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 IKZF3-215ENST00000535189 1996 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 ARFGEF3-201ENST00000251691 14877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 ATP2C1-208ENST00000504948 4714 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 NBPF26-206ENST00000617913 2931 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AL117339.5-201ENST00000640275 3955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 ASB4-202ENST00000325885 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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