Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 CCDC125-201ENST00000383374 2006 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 ARGFXP2-201ENST00000579304 949 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 MIR5010-201ENST00000582846 120 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AL109924.4-201ENST00000623089 670 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC010480.1-201ENST00000624823 684 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 MLIP-206ENST00000502396 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 GLYAT-203ENST00000529732 1070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC005479.3-201ENST00000602790 431 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC023632.6-201ENST00000624338 2177 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AL161756.1-201ENST00000555861 1751 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 CLC-201ENST00000221804 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 PSMD10-204ENST00000361815 768 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TM6SF1Q9BZW5 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.9 ms