Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC012613.1-202ENST00000512647 424 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC011352.2-201ENST00000514574 1016 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC092868.2-201ENST00000558749 497 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 DNM1P31-201ENST00000564149 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC007204.1-201ENST00000621794 555 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 MAPK10-357ENST00000641831 2858 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 LINC01990-201ENST00000609293 1487 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 C1D-202ENST00000407324 1379 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 TAS2R7-201ENST00000240687 1096 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 RNA5SP172-201ENST00000365061 118 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 NQO1-202ENST00000379046 1105 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 WDR82P2-201ENST00000444540 928 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 MRPS21P1-201ENST00000453850 223 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 KCNIP2-211ENST00000461105 858 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC093627.1-201ENST00000465755 877 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 C4orf19-203ENST00000508175 828 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AP001124.1-201ENST00000529628 385 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AP000907.3-201ENST00000530733 322 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 LDHC-204ENST00000536880 957 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC140118.1-201ENST00000539209 532 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC090673.2-201ENST00000544279 454 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC021755.3-201ENST00000560376 864 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 LINC01989-201ENST00000566930 1081 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 ARL17A-205ENST00000573185 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 ARL17B-206ENST00000575698 581 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 LINC01837-204ENST00000593211 570 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 RPS28P1-201ENST00000604589 187 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AL109936.2-201ENST00000605350 650 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC103724.4-201ENST00000605981 292 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 TMC5-205ENST00000542583 4872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 KIAA0391-203ENST00000534898 2611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.8 ms