Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AL355838.1-201ENST00000554814 559 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.2 ms