Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 SULT1C3-201ENST00000329106 915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AC005162.1-201ENST00000416513 389 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AL022324.2-201ENST00000434827 780 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AC114752.1-201ENST00000448204 289 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AC145285.4-201ENST00000568183 540 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 SKIV2L-216ENST00000628157 210 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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CUL4AQ13619 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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CUL4AQ13619 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AL035665.1-201ENST00000428495 1669 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 PLIN2-203ENST00000380465 631 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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CUL4AQ13619 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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CUL4AQ13619 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 FCRL2-205ENST00000469986 902 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 CT45A5-201ENST00000487941 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 LINC01093-201ENST00000506479 634 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AC024267.2-201ENST00000582737 417 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AC090774.2-201ENST00000584708 322 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AL589182.1-201ENST00000611785 320 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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