Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC087863.1-201ENST00000544515 570 ntTSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 LINC00520-204ENST00000556417 778 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 LINC00555-201ENST00000569288 442 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 IGFL1P2-201ENST00000593820 330 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AL096855.2-201ENST00000605785 369 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AC099811.5-201ENST00000617211 819 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AL109804.1-201ENST00000620777 562 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AC005691.1-201ENST00000624723 401 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 FMO8P-201ENST00000434461 1600 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 ATP5A1-202ENST00000398752 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AL022334.1-201ENST00000417397 1726 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AC096564.2-201ENST00000512428 3147 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 KPNA2-201ENST00000330459 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 DHX29-201ENST00000251636 4502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 MAPK8-206ENST00000374189 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 MTAP-201ENST00000380172 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 HLF-208ENST00000573945 2977 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 BABAM2-201ENST00000342045 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 CTBP2P2-201ENST00000434549 1334 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 NHLRC3-203ENST00000470258 3298 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 TMEM161B-201ENST00000296595 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 LARS2-203ENST00000415258 4744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 MIPOL1-202ENST00000396294 6258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AC105101.1-201ENST00000623698 2873 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 C2orf49-201ENST00000258457 4768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AL132655.3-201ENST00000603095 1619 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 EGFLAM-201ENST00000322350 4411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 MTBP-201ENST00000305949 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 MOBP-202ENST00000383754 3051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 PTGS1-207ENST00000619306 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 COPS4-201ENST00000264389 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 DCTN4-202ENST00000446090 1737 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 ZNF30-204ENST00000601142 2280 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 RAET1L-201ENST00000286380 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
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MKRN4PQ13434 ELOA-AS1-201ENST00000427796 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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MKRN4PQ13434 AL513122.2-201ENST00000437135 838 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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MKRN4PQ13434 AL772337.3-201ENST00000447524 452 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AC084251.1-201ENST00000521867 382 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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MKRN4PQ13434 AC116348.2-201ENST00000563751 577 ntTSL 4 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AC126323.4-201ENST00000566935 234 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AP005329.3-201ENST00000609924 686 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
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MKRN4PQ13434 SIMC1-201ENST00000332772 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 TMEM269-204ENST00000637012 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 CACNB2-204ENST00000377315 3461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 ZNF45-201ENST00000269973 3898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 FAM13C-214ENST00000611933 3033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
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MKRN4PQ13434 KCNK10-203ENST00000340700 7501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 OTUD7B-202ENST00000581312 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 AC125603.4-201ENST00000621942 2699 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 TMEM242-202ENST00000400788 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 ISX-202ENST00000404699 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 CDH26-201ENST00000244049 1931 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 DCN-220ENST00000552962 1930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 ARL11-201ENST00000282026 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 TNIK-203ENST00000357327 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 POGK-202ENST00000367876 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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