Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AC007283.1-201ENST00000434645 445 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
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ITGB3BPQ13352 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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ITGB3BPQ13352 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
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ITGB3BPQ13352 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
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ITGB3BPQ13352 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
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ITGB3BPQ13352 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
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