Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 AGTPBP1-202ENST00000357081 4393 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 MID1-202ENST00000380779 6044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 MELK-207ENST00000536860 2342 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 ZNF24-204ENST00000589881 7419 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 OR8J1-201ENST00000303039 1074 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 AC245047.1-201ENST00000433276 873 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 RPL7L1P11-201ENST00000446092 721 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 AC078788.1-201ENST00000498457 634 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 AC010976.1-205ENST00000596439 1007 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 DCX-208ENST00000636035 9269 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 OR4C1P-202ENST00000641065 1569 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 VRK2-203ENST00000417641 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 GUCY1B2-203ENST00000493639 2871 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 INTS2-207ENST00000617492 5805 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 AC008753.1-201ENST00000423096 284 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 TOM1L1-220ENST00000575333 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 RGPD1-201ENST00000398193 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 BRD8-202ENST00000254900 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 AL139805.2-201ENST00000455305 2433 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 ADAMTS6-203ENST00000381055 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 RALBP1-206ENST00000609094 3676 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 ZDBF2-201ENST00000374423 10286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 GPRIN3-201ENST00000333209 6260 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 PPARGC1A-217ENST00000613098 3210 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 OLFM3-202ENST00000370103 3255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 ART4-201ENST00000228936 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 ADA2-201ENST00000262607 3925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.5 ms