Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 RBPJ-201ENST00000342295 5860 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 BCOR-201ENST00000342274 6390 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 GABRB3-204ENST00000541819 5934 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 MON2-202ENST00000393630 13275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 LINC00282-202ENST00000627246 4008 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 UTY-210ENST00000538878 6574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 ATP8B1-201ENST00000283684 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 ATF7-202ENST00000456903 5218 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 CLASP2-225ENST00000635664 4176 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 CD163-201ENST00000359156 4268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 ERG-203ENST00000398905 4806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 CHD2-201ENST00000394196 9363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 FAM186A-204ENST00000543111 8200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 CD109-203ENST00000437994 9401 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 IYD-202ENST00000344419 8742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 NRCAM-203ENST00000379024 5782 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 COL4A6-201ENST00000334504 6700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 ZBTB43-203ENST00000449886 5851 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 ABLIM1-206ENST00000392952 6841 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 MRPS23-201ENST00000313608 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 SYTL5-202ENST00000456733 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 SCN9A-203ENST00000409672 9768 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
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