Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AC004063.1-201ENST00000508358 547 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AC113191.1-201ENST00000517759 403 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 TPT1-AS1-209ENST00000520585 818 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 IGHVIII-11-1-201ENST00000522733 267 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 SOX9-AS1-211ENST00000533179 460 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AC012594.1-252ENST00000595011 876 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 TINAG-201ENST00000259782 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 GDPD4-201ENST00000315938 2533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
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PGGT1BP53609 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
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PGGT1BP53609 C2orf88-202ENST00000396974 998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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PGGT1BP53609 AC104823.1-201ENST00000413290 989 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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PGGT1BP53609 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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PGGT1BP53609 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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PGGT1BP53609 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AC090791.1-201ENST00000530960 492 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 ARF4-AS1-203ENST00000607782 552 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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