Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 ZNF37A-201ENST00000351773 7027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 ZC3H11B-202ENST00000636126 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 CASC19-205ENST00000641013 1411 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 TTC21A-203ENST00000431162 4209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 UBE2V1-201ENST00000340309 2536 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 NFX1-203ENST00000379540 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 SUPT7L-202ENST00000404798 4114 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 TRIM66-202ENST00000402157 10086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 IL5RA-207ENST00000438560 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 RBM23-203ENST00000359890 10040 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 PDE4DIP-203ENST00000369349 4677 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 ARMC8-210ENST00000469044 4790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 UBE4B-202ENST00000343090 5267 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 SORBS1-211ENST00000371247 7354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 TNC-202ENST00000350763 7641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 LRP2BP-202ENST00000505916 2302 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 AC139493.1-201ENST00000604368 397 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 MIR8089-201ENST00000620165 82 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 AC021079.1-201ENST00000625268 907 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
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PTPRMP28827 C20orf194-201ENST00000252032 6869 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 ART4-201ENST00000228936 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 TBC1D30-204ENST00000542120 7433 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
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PTPRMP28827 BUB3-203ENST00000368865 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
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PTPRMP28827 TTTY15-202ENST00000440408 5284 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 LGSN-202ENST00000370658 5213 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 PPP2R5C-205ENST00000445439 1526 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
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PTPRMP28827 EFCAB6-203ENST00000396231 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
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PTPRMP28827 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
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PTPRMP28827 AC087664.2-202ENST00000521274 515 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
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PTPRMP28827 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 TMC5-205ENST00000542583 4872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 MAPK10-344ENST00000641718 3746 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 AL023806.3-201ENST00000638502 2704 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.01
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